QCM : Techniques de biologie moléculaire — 29 questions

Explication

La PCR est une réaction de polymérisation en chaîne qui augmente la quantité d’une séquence d’ADN grâce à une ADN polymérase ADN-dépendante. La traduction produit des protéines, tandis que la dégradation de l’ADN et la synthèse d’ARN correspondent à d’autres processus.

Explication

L’électrophorèse sépare les acides nucléiques en fonction de leur longueur grâce à leur migration dans un champ électrique continu. La couleur, la température de dénaturation et l’affinité enzymatique ne constituent pas le principe de cette séparation.

Explication

L’ADN polymérase allonge une amorce en synthétisant un brin complémentaire du brin matrice. La séparation des brins relève d’autres mécanismes, et la polymérase ne se limite pas à reconnaître la séquence.

Explication

Une différence d’un cycle signifie que l’échantillon ayant le Ct le plus élevé possède une quantité initiale d’ARNm deux fois plus faible. Un Ct plus élevé ne traduit donc pas une concentration supérieure ou identique.

Explication

Le Ct correspond au nombre de cycles nécessaires pour que la fluorescence atteigne un seuil défini et sert à estimer la concentration initiale en ARNm. Il ne désigne ni la longueur de l’amplicon ni le nombre de fragments après digestion.

Explication

Les nucléases sont des hydrolases, plus précisément des estérases, qui coupent la liaison phosphoester reliant le sucre au groupement phosphate. Les autres liaisons concernent des structures chimiques différentes et ne constituent pas leur cible décrite.

Explication

La charge négative des acides nucléiques les repousse de la cathode négative et les attire vers l’anode positive. Une migration vers la cathode ou vers le centre ne correspond donc pas au fonctionnement du champ électrique.

Explication

Une endonucléase coupe une liaison située entre deux nucléotides à l’intérieur de la séquence. Une exonucléase, au contraire, retire les nucléotides depuis une extrémité de l’acide nucléique.

Explication

La détection commence par la séparation des brins d’ADN, suivie de l’hybridation de la sonde avec le brin complémentaire, puis de la visualisation de son marquage. Détecter le marquage avant l’hybridation ne permettrait pas de localiser la séquence ciblée.

Explication

Une ADN polymérase ARN-dépendante utilise une matrice d’ARN pour synthétiser l’ADN correspondant. Une ADN polymérase ADN-dépendante nécessite au contraire une matrice d’ADN.

Explication

Les fragments courts se déplacent plus facilement dans le gel et migrent donc plus loin et plus rapidement que les fragments longs. La longueur, et non la composition en bases ou une charge positive, détermine cette différence de migration.

Explication

Les RNases sont les nucléases qui hydrolysent l’ARN, tandis que les DNases ciblent l’ADN. Les termes exonucléase et endonucléase décrivent la position de coupure, pas nécessairement le type d’acide nucléique ciblé.

Explication

La PCR digitale consiste à compartimenter l’échantillon, effectuer la PCR dans chaque compartiment et compter les compartiments positifs à l’aide d’un calcul fondé sur la loi de Poisson. Une mesure globale de fluorescence ne tient pas compte de cette partition ni du modèle statistique associé.

Explication

La PCR digitale répartit l’échantillon dans des milliers de gouttelettes ou de puits et dénombre les compartiments positifs pour estimer directement le nombre de copies. La comparaison à une gamme d’étalonnage caractérise plutôt une quantification relative ou dépendante d’un standard.

Explication

L’enzyme reconnaît une séquence précise de quatre à six paires de bases, souvent palindromique, et coupe les deux brins si la correspondance est exacte. L’appariement des extrémités décrit une conséquence possible de la coupure, pas sa condition de reconnaissance.

Explication

La lyse des protéines ouvre la procédure avant la fixation, le lavage et l’élution des acides nucléiques. La fixation intervient après cette étape initiale, et non avant elle.

Explication

La PCR-RFLP révèle un polymorphisme de longueur des fragments de restriction après amplification PCR puis digestion enzymatique. La quantification de l’ARN et l’analyse de fluorescence en temps réel relèvent d’autres méthodes moléculaires.

Explication

Une sonde moléculaire est une petite séquence d’ADN conçue pour s’apparier de façon complémentaire et antiparallèle avec la séquence ciblée. Une séquence identique et parallèle ne permet pas l’appariement correct des bases.

Explication

Un cycle de PCR commence par la dénaturation à 94 °C, se poursuit par l’hybridation des amorces à 60–65 °C et se termine par l’élongation à 72 °C. La permutation de ces températures attribue à chaque étape une condition qui ne correspond pas à son rôle.

Explication

L’ARN est particulièrement vulnérable aux ribonucléases présentes notamment sur la peau, ce qui impose des précautions supplémentaires. L’ADN est au contraire décrit comme très stable dans ces conditions.

Explication

La rétrotranscription nécessite une matrice ARN, une amorce, des dNTP et une ADN polymérase ARN-dépendante appelée rétrotranscriptase. Une enzyme de restriction, une ligase ou des acides aminés ne remplissent pas les fonctions requises dans cette étape.

Explication

La synthèse in vitro requiert une matrice simple brin, une amorce, des désoxyribonucléotides triphosphates et une ADN polymérase. Les ribosomes, les acides aminés et les lipides ne constituent pas les éléments nécessaires à cette réaction.

Explication

Une extrémité cohésive comporte un brin dépassant qui peut s’apparier par complémentarité avec une séquence compatible. Une extrémité franche ne permet pas cet appariement terminal, car les deux brins se terminent au même niveau.

Explication

Lorsque l’enzyme reconnaît et découpe l’amplicon, plusieurs fragments plus courts sont produits et observés après électrophorèse. Un fragment unique de longueur initiale correspond au contraire à une absence de digestion.

Explication

Les enzymes de restriction sont produites par les bactéries pour hydrolyser le génome de certains virus infectieux sans dégrader le génome bactérien producteur. Elles agissent donc comme des endonucléases de défense, et non comme des enzymes de réplication ou d’assemblage.

Explication

Les polymérases synthétisent le nouvel acide nucléique dans le sens 5’ vers 3’ en ajoutant chaque nucléotide à l’extrémité 3’ libre. Confondre le sens global de synthèse avec l’extrémité d’ajout conduit à choisir une combinaison incorrecte.

Explication

Une PCR-RFLP commence par l’extraction de l’ADN, suivie de l’amplification de la séquence, de la digestion de l’amplicon et de l’électrophorèse. La rétrotranscription et le séquençage ne font pas partie de cette succession décrite.

Explication

La RT-PCR permet d’étudier l’expression d’un gène en convertissant son ARNm en ADN complémentaire, puis en amplifiant cet ADNc. Elle ne repose pas sur la digestion de l’ADN génomique ni sur une mesure directe des protéines.

Explication

Les globules rouges sont l’exception mentionnée, car ils ne contiennent pas d’ADN. Les autres exemples proposés correspondent à des cellules susceptibles de fournir de l’ADN.