QCM : Transfert génétique et phylogénie bactérienne (11 questions)

Explication

La génétique microbienne peut optimiser les bioconversions, la production de métabolites et l’expression de protéines hétérologues, ainsi que développer de nouvelles capacités chez les organismes utilisés. La détection des pathogènes relève de la médecine, les interactions écologiques d’un autre domaine d’application, et l’évolution des pathogènes de l’épidémiologie moléculaire.

Explication

En médecine, la génétique microbienne contribue à détecter et identifier les pathogènes, étudier la transmission et rechercher des cibles de traitements ou d’immunoprophylaxies. L’optimisation de production est biotechnologique, les outils de génie génétique relèvent ici de la recherche fondamentale, et les interactions avec l’environnement constituent un autre axe.

Explication

Un chromosome bactérien mesure typiquement de 1 à 10 Mb et possède généralement les caractéristiques décrites dans le cas. La plage de 5 à 200 kb correspond aux plasmides, tandis que les transposons sont indiqués comme mesurant de 2 à 20 kpb.

Explication

Le transfert vertical transmet le chromosome à la descendance, alors que le transfert horizontal permet le passage de portions entre bactéries. Dire que le chromosome entier est transféré horizontalement inverse les mécanismes décrits, et classer les deux transmissions comme verticales ou horizontales confond leurs destinataires.

Explication

Le génome humain est indiqué comme mesurant environ 3 000 Mb et comprenant près de 20 000 gènes. La valeur de 5 Mb correspond plutôt à l’ordre de grandeur donné pour Escherichia coli.

Explication

Bacillus anthracis est décrit comme un clade peu variable dans le groupe Bacillus cereus sensu lato. À l’inverse, B. thuringiensis ne forme pas un groupe monophylétique avec les espèces auxquelles son phénotype pourrait le rattacher.

Explication

La concaténation de plusieurs loci, typiquement environ sept gènes non liés, fournit davantage d’information qu’une analyse fondée sur un seul gène. Les gènes d’ARNr sont plutôt utiles pour comparer des espèces, mais leur évolution lente limite leur pouvoir discriminant au sein d’une espèce.

Explication

Les transferts horizontaux peuvent produire des parentés multiples, que le réseau phylogénétique permet de représenter tout en conservant des clades pertinents. Un arbre classique convient moins bien, car il décrit les relations sous forme de ramifications plutôt que de transferts entre lignées.

Explication

La conjugaison est le mécanisme typique de transfert horizontal des plasmides, alors que les bactériophages peuvent transférer du matériel génétique par transduction ou lysogénie. La transduction concerne les phages, et non le mécanisme typique de transfert des plasmides.

Explication

La transformation peut transférer horizontalement de l’ADN chromosomique lorsqu’une bactérie l’internalise. La ségrégation après réplication correspond plutôt à la transmission verticale du chromosome.

Explication

Après son internalisation, l’ADN transformant peut survivre et s’intégrer au génome ou être recombiné, puis éventuellement se répliquer. La formation d’un pilus sexuel relève de la conjugaison, et non de la transformation.