Fiche de révision : Biochimie analytique et prélèvement urinaire

📋 Plan du Cours

1. Organisation et évaluation de l’UE
2. Enjeux de la biochimie analytique
3. Avantages et limites urinaires
4. Protocoles de prélèvement urinaire
5. Conservation et tubes urinaires
6. Formation et composition de l’urine
7. Hydrolyse de l’urée et précipitations

📖 1. Organisation et évaluation de l’UE

★ À maîtriser

• L’UE comprend quatre blocs:
  • biochimie analytique
  • enzymologie
  • biochimie métabolique
  • applications biochimiques en santé

📌 Les travaux dirigés sont obligatoires et une absence injustifiée signalée à la scolarité peut entraîner une sanction.

📌 En première et deuxième session, l’évaluation repose uniquement sur des QCM comportant cinq propositions, dont au moins une est juste et au moins une est fausse.

Compléments

• L’enseignement comprend 16 cours magistraux et 4 travaux dirigés non notés, répartis en 12 groupes de GP1 à GP12.

📖 2. Enjeux de la biochimie analytique

🔑 Notions clés & Définitions

• Biochimie analytique : Science qui analyse des échantillons humains afin d’explorer les réactions biochimiques.

★ À maîtriser

• Les analyses servent à:
  • suivre l’état de santé
  • dépister ou diagnostiquer une pathologie
  • ajuster un traitement
  • surveiller un traitement médicamenteux

📌 Un prélèvement biologique peut être liquidien, comme le sang, l’urine ou un liquide de ponction, ou tissulaire, comme une biopsie.

📌 Le choix du prélèvement dépend de la question clinique, du patient, du contexte, de la précision attendue et du coût de l’analyse.

Compléments

• Chez un nourrisson présentant une fièvre légère, des urines peu abondantes mais fréquentes et des pleurs inexpliqués, l’analyse d’urine est privilégiée en première intention car elle est rapide et non invasive.

💡 Astuce mémo

Choix du prélèvement → analyse adaptée au patient et à la question clinique

📖 3. Avantages et limites urinaires

★ À maîtriser

• Le prélèvement urinaire est simple, pratique, peu coûteux et non invasif, ce qui explique son utilisation fréquente en infectiologie et en toxicologie.

📌 L’urine est moins tamponnée que le sang, de sorte que son pH et ses concentrations ioniques sont plus variables et que ses résultats sont moins précis.

Compléments

• L’urine possède des biomarqueurs limités et la présence d’urée constitue un frein biologique pour l’analyse de pathologies complexes.

• Pour les études toxicologiques à long terme, l’analyse capillaire est privilégiée plutôt que l’analyse urinaire.

💡 Astuce mémo

Urine : non invasive et pratique ; sang : plus invasif mais souvent plus précis

📖 4. Protocoles de prélèvement urinaire

★ À maîtriser

• 🔄 Le protocole commun consiste à:
  1. désinfecter les mains
  2. désinfecter la zone de prélèvement
  3. choisir le jet urinaire adapté
  4. recueillir l’échantillon selon le patient

📌 Le premier jet explore les germes de l’urètre ou de la zone vulvaire, tandis que le milieu de jet est représentatif de l’urine vésicale et limite la contamination par la flore commensale.

• Le recueil dépend du patient: chez le nourrisson, avec un collecteur, chez le patient sondé, par ponction sur le site spécifique de la sonde après désinfection et clampage, chez l’adulte, par jet dans un pot à canule stérile

Compléments

• Les analyses urinaires concernent notamment: l’ECBU, l’osmolarité, la composition urinaire, les dosages toxicologiques, la recherche de biomarqueurs physiopathologiques

💡 Astuce mémo

Désinfecter → choisir le jet → recueillir → identifier le tube

📖 5. Conservation et tubes urinaires

★ À maîtriser

• Le tube beige sans additif est utilisé pour la chimie urinaire, notamment la protéinurie, la glycosurie et la micro-albuminurie.

• Le tube jaune ou vert contenant de l’acide borique, du formate de sodium et du borate de sodium est utilisé pour la bactériologie urinaire et l’ECBU.

• Une conservation prolongée entraîne: une prolifération bactérienne, une augmentation du pH, une production d’ammonium, la formation de cristaux, l’oxydation de la bilirubine et de l’urobilinogène, la dégradation des éléments cellulaires, la perte des corps cétoniques, une diminution du glucose

📌 L’acide borique préserve les protéines et les éléments formés et est bactériostatique, mais il peut interférer avec les drogues et certaines hormones, précipiter à forte concentration et empêcher la mesure du pH.

Compléments

📌 Les conservateurs urinaires réduisent la croissance bactérienne, diminuent la décomposition chimique, maintiennent les composés en solution et limitent leur oxydation atmosphérique.

💡 Astuce mémo

Attente prolongée → prolifération bactérienne → modifications chimiques et cellulaires

📖 6. Formation et composition de l’urine

🔑 Notions clés & Définitions

• Hydrolyse : Réaction chimique et enzymatique dans laquelle une liaison covalente est rompue par l’action d’une molécule d’eau.

★ À maîtriser

• 🔄 La formation de l’urine résulte de:

  1. la filtration glomérulaire du sang
  2. le passage dans les canaux
  3. la réabsorption des composés bénéfiques
  4. l’excrétion vers la vessie

• La composition de l’urine est de 95 % d’eau, 2 % d’urée, 0,6 % d’ions chlorure, 0,6 % de potassium, 0,18 % de sulfate, 0,12 % de phosphate, 0,1 % de sodium, 0,1 % de créatinine, 0,05 % d’ammoniac, 0,03 % d’acide urique, 0,015 % de calcium et 0,01 % de magnésium.

• La créatinine est un marqueur de la dégradation musculaire et de la fonction rénale.

Compléments

• Les échanges entre le sang et l’urine sont rendus possibles par un épithélium très spécialisé et fin appelé épithélium fenestré.

📖 7. Hydrolyse de l’urée et précipitations

★ À maîtriser

• L’urine humaine a initialement un pH compris entre 5,5 et 7 et est stérile chez les individus en bonne santé.

• 🔄 Dans l’urine stockée: les uréases bactériennes catalysent l’hydrolyse de l’urée, l’urée produit de l’ammoniaque, de l’ammonium et du bicarbonate, le pH devient alcalin, le pH atteint des valeurs comprises entre 8,5 et 9,5

• L’augmentation du pH liée à l’hydrolyse de l’urée déclenche la précipitation du phosphore, du calcium et du magnésium sous forme de struvite, d’hydroxyapatite et occasionnellement de calcite.

Compléments

📐 Formule — La struvite formée dans l’urine stockée correspond à des cristaux de $MgNH_4PO_4 \cdot 6H_2O$.

• L’hydroxyapatite formée lors de la précipitation urinaire a pour formule $Ca_5(PO_4)_3(OH)$, tandis que la calcite, plus occasionnelle, a pour formule $CaCO_3$.

💡 Astuce mémo

Uréase bactérienne → ammonium → pH alcalin → cristaux

📊 Tableaux de synthèse

Choix des tubes urinaires