Fiche de révision : Infections urinaires et entérobactéries

Plan du Cours

  1. Définitions et formes cliniques
  2. Épidémiologie et symptômes
  3. Complications des infections urinaires
  4. Mécanismes et facteurs favorisants
  5. Classification et étiologie bactérienne
  6. Diagnostic par bandelette et ECBU
  7. Antibiogramme et examens complémentaires
  8. Traitement des infections urinaires
  9. Entérobactéries : caractères généraux
  10. Escherichia coli et autres espèces

1. Définitions et formes cliniques

Notions clés & Définitions

  • Microbiote urinaire : Ensemble de microorganismes vivant dans l’arbre urinaire et la vessie, où les Lactobacillus représentent plus de 55 % des microorganismes identifiés.

Points essentiels

📌 La cystite est une infection urinaire basse limitée à la vessie, tandis que la pyélonéphrite est une infection urinaire haute atteignant le parenchyme rénal après remontée bactérienne dans l’arbre urinaire.

Astuce mémo

Cystite = vessie ; pyélonéphrite = rein

2. Épidémiologie et symptômes

Notions clés & Définitions

  • Colonisation urinaire : Présence en quantité importante d’une bactérie potentiellement pathogène dans les urines sans symptômes urinaires.

Points essentiels

  • Les infections urinaires sont les deuxièmes infections les plus fréquentes après les infections respiratoires et leur incidence est dix fois plus élevée chez la femme que chez l’homme.

  • Les symptômes de cystite comprennent:

    • les brûlures mictionnelles
    • la pollakiurie
    • la dysurie ou pyurie
    • l’hématurie
    • les douleurs sus-pubiennes

3. Complications des infections urinaires

Points essentiels

  • Une cystite récidivante correspond à plus de quatre épisodes de cystite par an.

  • 🔄 L’évolution possible suit la séquence: cystite, pyélonéphrite, bactériémie ou septicémie, atteinte d’autres organes ou abcès péri-néphrétiques

Astuce mémo

Remontée bactérienne → pyélonéphrite → bactériémie

4. Mécanismes et facteurs favorisants

Points essentiels

  • La contamination urinaire est généralement ascendante à partir de la flore périnéale, tandis que la contamination descendante par voie sanguine représente environ 3 % des cas.

  • Les mécanismes protecteurs comprennent:

    • le pH acide
    • la longueur urétrale
    • le reflux vésico-urétéral
    • la muqueuse défavorable à l’adhérence
    • les IgA
    • la flore périnéale protectrice
    • la vidange vésicale régulière et complète
  • Les facteurs favorisants liés à l’hôte comprennent:

    • les malformations ou obstructions urinaires
    • les compressions
    • les corps étrangers ou sondes
    • le diabète
    • la neuropathie vésicale
  • Les facteurs de virulence des UPEC comprennent:

    • les fimbriae de type 1 favorisant la cystite
    • les fimbriae P favorisant la pyélonéphrite
    • l’hémolysine
    • les sidérophores
    • l’uréase

Astuce mémo

Urètre court favorisant chez la femme, reflux protecteur

5. Classification et étiologie bactérienne

Points essentiels

  • Les catégories principales sont:

    • les infections simples
    • les infections à risque de complications
    • les infections récidivantes
  • Les principales bactéries responsables sont Escherichia coli dans environ 90 % des infections urinaires, Proteus mirabilis et Staphylococcus saprophyticus surtout chez les femmes jeunes de 15 à 25 ans.

6. Diagnostic par bandelette et ECBU

Points essentiels

📌 Une bandelette urinaire est utilisée pour une cystite simple ou le dépistage mensuel des femmes enceintes à partir du quatrième mois, tandis qu’un ECBU est indiqué en cas de cystite à risque de complications, de cystite récidivante ou de pyélonéphrite.

  • La bandelette urinaire détecte le pH, les leucocytes estérases et les nitrites produits par la réduction des nitrates par les entérobactéries.

  • 🔄 Le prélèvement d’un ECBU adulte consiste à: attendre au moins trois heures de séjour vésical, réaliser une toilette soigneuse, éliminer le premier jet, recueillir le milieu du jet dans un flacon stérile

📐 Formule — La leucocyturie est significative au-delà de 10 GB/mm310\ \text{GB/mm}^3 ou de 104 GB/mL10^4\ \text{GB/mL}.

📐 Formule — Pour une seule espèce bactérienne, une bactériurie inférieure à 103 UFC/mL10^3\ \text{UFC/mL} n’est pas significative, une valeur supérieure à 105 UFC/mL10^5\ \text{UFC/mL} rend l’infection probable et la zone comprise entre 10310^3 et 104 UFC/mL10^4\ \text{UFC/mL} est incertaine.

Astuce mémo

Prélever → cultiver → identifier → dénombrer

7. Antibiogramme et examens complémentaires

Notions clés & Définitions

  • Antibiogramme : Évalue in vitro la sensibilité d’une bactérie aux antibiotiques ; un grand diamètre d’inhibition indique une sensibilité, tandis qu’une croissance au contact de l’antibiotique indique une résistance.

Points essentiels

📌 Une hémoculture est indiquée dans les formes sévères ou en cas de sepsis, tandis qu’un uroscanner ou une échographie rénale recherche une cause favorisante ou une complication.

Astuce mémo

Grand diamètre = sensible ; croissance au contact = résistante

8. Traitement des infections urinaires

Points essentiels

  • Le traitement d’une cystite simple repose en première intention sur la fosfomycine-trométamol en dose unique, puis sur le pivmécillinam pendant cinq jours si nécessaire.

  • Le traitement initial dépend de la gravité: fluoroquinolone per os pour la pyélonéphrite simple, céphalosporine de troisième génération injectable pour la forme à risque de complication, céphalosporine de troisième génération associée à l’amikacine pour la forme grave

📌 Une infection urinaire masculine est considérée d’emblée comme compliquée, nécessite un ECBU et est traitée par une fluoroquinolone ou du cotrimoxazole pendant 14 à 21 jours en raison de leur diffusion prostatique.

📌 Chez la femme enceinte, une colonisation urinaire est retenue à partir de 10^5 UFC/mL sur deux ECBU et doit être traitée en raison d’un risque d’évolution vers une pyélonéphrite.

9. Entérobactéries : caractères généraux

Notions clés & Définitions

  • Entérobactéries : Bacilles à Gram négatif, aéro-anaérobies facultatifs, oxydase négative et généralement issus du tube digestif de l’homme ou des animaux.

Points essentiels

  • Les caractères biochimiques communs sont:

    • l’oxydase négative
    • la nitrate-réductase positive
    • la fermentation du glucose
  • Le lipopolysaccharide comprend:

    • le lipide A
    • le core central
    • la partie polysaccharidique de spécificité O

📌 Les entérobactéries opportunistes provoquent surtout des infections endogènes ou nosocomiales, tandis que les entérobactéries pathogènes spécifiques proviennent d’une contamination exogène et provoquent notamment des syndromes digestifs.

Astuce mémo

GNOF : Gram négatif, oxydase négative, facultatives

10. Escherichia coli et autres espèces

★ À maîtriser

  • Escherichia coli est un hôte intestinal normal représentant environ 80 % de la flore fécale et un indicateur de contamination fécale dans l’environnement.

  • Les six groupes d’E. coli responsables d’infections intestinales sont les ECEP, ECET, ECEH, ECEI, ECEA et ECAD.

  • Les fimbriae de type 1 d’Escherichia coli sont associés aux cystites et les fimbriae P aux pyélonéphrites.

Compléments

  • Les infections extra-intestinales d’E. coli comprennent:
    • les infections urinaires
    • les infections génitales
    • les suppurations abdominales
    • les infections pulmonaires
    • les septicémies
    • les endocardites
    • les méningites néonatales

Tableaux de synthèse

Orientation diagnostique selon la situation

SituationExamen principalÉlément clé
Cystite simpleBandelette urinaireLeucocytes et nitrites
Cystite à risque ou récidivanteECBUCulture et antibiogramme
PyélonéphriteECBURecherche de bactériurie significative
Forme sévère ou sepsisECBU et hémoculturesRecherche de bactériémie

Principales formes et traitements

SituationPremière intentionDurée ou particularité
Cystite simpleFosfomycine-trométamolDose unique
Cystite à risqueNitrofurantoïneAdaptation à l’antibiogramme
Pyélonéphrite simpleFluoroquinolone per os7 jours
Infection urinaire masculineFluoroquinolone ou cotrimoxazole14 à 21 jours

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Qu'est-ce que le microbiote urinaire ?

Un ensemble de microorganismes vivant dans l’arbre urinaire et la vessie.

Quel pourcentage des microorganismes du microbiote urinaire sont des Lactobacillus ?

Plus de 55 % des microorganismes identifiés.

Quelle infection urinaire est limitée à la vessie ?

La cystite.

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