QCM : Calcul de risque en génétique (22 questions)

Explication

Le risque mendélien de transmission de l’allèle muté est de 1/2, puis il est multiplié par la pénétrance : $\frac{1}{2}\times0{,}8=0{,}4$, soit 40 %. Le risque de 50 % correspondrait à une pénétrance complète.

Explication

Dans cette situation familiale, le risque de présenter la maladie autosomique récessive est de 1/4. La proportion de 2/3 concerne le risque d’être hétérozygote indemne chez un membre de la fratrie qui est lui-même indemne.

Explication

Parmi les enfants indemnes issus de deux parents porteurs, deux sur trois sont porteurs hétérozygotes. Le risque de 1/4 correspond à celui d’être atteint avant de tenir compte de l’absence de maladie chez la personne considérée.

Explication

La mère transmet l’X porteur de la mutation à une probabilité de 1/2, et la probabilité que l’enfant concerné soit un garçon est également de 1/2, soit $\frac{1}{2}\times\frac{1}{2}=\frac{1}{4}$. La moitié correspond au risque de recevoir l’X maternel muté, sans intégrer le sexe de l’enfant.

Explication

L’autozygotie désigne une homozygotie identique dont les deux allèles dérivent d’un même ancêtre commun. La simple homozygotie indique une identité allélique, mais ne démontre pas cette origine commune.

Explication

L’hétérozygotie composite associe deux mutations différentes sur les deux allèles d’un même gène. Le double hétérozygote concerne au contraire deux anomalies réparties sur deux gènes différents.

Explication

Les fréquences des trois génotypes sont $p^2$, $2pq$ et $q^2$, dont la somme vaut 1. La relation $p+q=1$ décrit les fréquences alléliques et non la distribution génotypique.

Explication

La fréquence des hétérozygotes est donnée par $2pq$. Les expressions $p^2$ et $q^2$ correspondent respectivement aux deux catégories d’homozygotes.

Explication

L’équilibre suppose notamment une population de grande taille et panmictique, ainsi que l’absence de migration, de mutation et de sélection. La consanguinité, la petite taille, les migrations ou la sélection introduisent des écarts par rapport à ces conditions.

Explication

La fréquence de la maladie correspond à $q^2$, ce qui donne $q=1/100$, puis la fréquence des porteurs est approximativement $2pq=1/50$. Confondre $q^2$ avec $2pq$ conduirait à attribuer la fréquence de la maladie aux porteurs.

Explication

Le risque est le produit de la transmission par le parent concerné, de l’hétérozygotie du nouveau conjoint et de la transmission de l’allèle muté : $1/2\times1/50\times1/2=1/200$. Le risque ne vaut pas $1/100$, car il faut aussi tenir compte de la probabilité que le nouveau conjoint soit porteur.

Explication

Le frère indemne a une probabilité de $2/3$ d’être porteur, puis les deux parents doivent transmettre l’allèle muté : $2/3\times1/2\times1/25\times1/2=1/150$. Le calcul $1/100$ omettrait la probabilité conditionnelle que le frère indemne soit porteur.

Explication

La consanguinité décrit la proportion d’allèles homozygotes par filiation, appelés autozygotes, chez l’individu issu de l’union apparentée. La comparaison entre deux individus relève plutôt de la parenté.

Explication

L’autozygotie survient lorsqu’un même allèle descend d’un ancêtre commun par les deux branches familiales et est ensuite hérité en double copie. Deux mutations indépendantes dans les gamètes ne constituent pas une identité par filiation.

Explication

La consanguinité favorise l’homozygotie d’allèles récessifs et augmente donc le risque des maladies autosomiques récessives. Elle ne modifie pas le risque des autres maladies génétiques dans le cadre de cette règle.

Explication

$m$ et $p$ comptent les chaînons reliant les deux parents à chaque ancêtre commun, ce qui permet de calculer la contribution de cet ancêtre à $F$. Le coefficient $F$ concerne l’autozygotie de l’individu, et non le nombre d’allèles mutés familiaux.

Explication

Les coefficients sont respectivement $1/4$ pour une union frère-sœur, $1/8$ pour une union oncle-nièce et $1/16$ pour des cousins germains ayant deux ancêtres communs. La valeur $1/32$ correspond à des cousins germains avec un seul ancêtre commun, et non à la configuration habituelle à deux ancêtres.

Explication

Lorsque la fréquence allélique mutée est faible, le risque d’homozygotie est approximativement la somme du risque populationnel $q^2$ et du terme supplémentaire lié à la consanguinité, $Fq$. La confusion fréquente consiste à retenir $q^2$ seul, qui correspond au risque populationnel sans l’effet de la consanguinité.

Explication

Le risque relatif compare le risque associé à la consanguinité au risque de la population générale et se calcule ici par $RR=F/q+1$. Le coefficient $F$ pris isolément mesure l’autozygotie et ne constitue pas, à lui seul, un risque relatif.

Explication

Dans cet exemple de consanguinité entre cousins germains, le risque de phénylcétonurie est d’environ $1/1600$ et le risque relatif atteint $6$. Le risque populationnel $1/10000$ ne tient pas compte de l’augmentation due à la parenté des parents.

Explication

La parenté mesure la proportion d’allèles identiques par filiation entre deux individus comparés. La consanguinité, en revanche, concerne l’autozygotie d’un individu issu d’une union entre apparentés.

Explication

La parenté entre cousins germains est de $1/8$, selon la diminution du nombre de liens de filiation communs. La valeur $1/2$ correspond à la parenté entre frère et sœur, et non à celle entre cousins germains.