QCM : Génétique P1 (11 questions)

Questions et réponses du QCM

1. Un laboratoire choisit une puce HD pour analyser un échantillon. Quel ordre de grandeur du nombre de marqueurs doit-il prévoir ?

Environ 600 000 marqueurs
Environ 100 000 marqueurs
Environ 10 000 marqueurs
Environ 50 000 marqueurs

Environ 600 000 marqueurs

Explication

Une puce HD comporte environ 600 000 marqueurs. Les valeurs de 10 000 et 50 000 correspondent respectivement aux densités LD et MD, tandis que 100 000 est une autre valeur mentionnée pour l’analyse de SNP, pas la densité HD indiquée ici.

2. Que détermine le génotypage chez un animal à partir de son ADN ?

Les performances exprimées
Le type d’échantillon prélevé
Les allèles présents
La généalogie complète

Les allèles présents

Explication

Le génotypage détermine les allèles présents chez l’animal en analysant son ADN. Les performances exprimées relèvent de la manifestation des caractères, tandis que la généalogie et le type d’échantillon ne sont pas les allèles recherchés.

3. Après avoir prélevé un échantillon et extrait l’ADN, une équipe analyse les variations avec une puce. Quelle étape vient ensuite dans le génotypage ?

Évaluer les performances de l’animal
Extraire de nouveau l’ADN des cellules
Réaliser un nouveau prélèvement de l’animal
Obtenir le profil génétique de l’animal

Obtenir le profil génétique de l’animal

Explication

Après l’analyse des variations génétiques avec la puce, le processus aboutit à l’obtention du profil génétique de l’animal. Refaire le prélèvement ou l’extraction inverse l’ordre des étapes, et l’évaluation des performances n’est pas l’étape finale du génotypage.

4. Un éleveur veut connaître le patrimoine génétique d’un jeune animal avant que ses performances soient observables. Quelle méthode répond à ce besoin ?

Le génotypage de son ADN
L’examen de sa généalogie
L’évaluation de ses performances
L’observation de son phénotype

Le génotypage de son ADN

Explication

Le génotypage permet de connaître le patrimoine génétique sans attendre l’expression des performances. L’évaluation des performances exige qu’elles se manifestent, et la généalogie ou les caractères visibles ne déterminent pas directement les allèles de l’animal.

5. Qu’est-ce qu’un SNP dans le génome ?

Une différence du nombre de chromosomes entre cellules
Une modification simultanée de plusieurs gènes voisins
Une répétition d’un segment complet de chromosome
Une variation portant sur une seule base de l’ADN

Une variation portant sur une seule base de l’ADN

Explication

Un SNP correspond à la variation d’une seule base de l’ADN et sert de repère génétique. Une modification de plusieurs gènes voisins concerne une région plus large que la définition d’un SNP.

6. En race Charolaise, quel est l’effet relatif de F94L sur le développement musculaire au sevrage par rapport à celui de Q204X ?

Son effet est sensiblement trois fois moindre que celui de Q204X.
Son effet est sensiblement deux fois supérieur à celui de Q204X.
Son effet est sensiblement égal à celui de Q204X.
Son effet est sensiblement deux fois moindre que celui de Q204X.

Son effet est sensiblement deux fois moindre que celui de Q204X.

Explication

En race Charolaise, l’effet de F94L sur le développement musculaire au sevrage est indiqué comme sensiblement moitié moindre que celui de Q204X. Les deux mutations ségrègent dans cette race, mais leurs effets ne sont donc pas décrits comme équivalents.

7. Dans un programme d’introgression, à quoi sert principalement le génotypage au fil des générations de croisement ?

À suivre le gène recherché, les proportions de génome des races et l’avancement du programme
À évaluer la diversité génétique de la race receveuse et à sélectionner les reproducteurs les plus âgés
À mesurer les performances de production et à fixer le calendrier des mises à la reproduction
À déterminer les caractères visibles des animaux et à prévoir leur adaptation au milieu

À suivre le gène recherché, les proportions de génome des races et l’avancement du programme

Explication

Le génotypage permet de vérifier la présence du gène visé, la part de génome provenant de chaque race et la progression de l’introgression. Mesurer les performances de production peut guider une sélection, mais ne correspond pas aux trois éléments suivis ici.

8. Parmi les propositions suivantes, laquelle décrit une limite du génotypage plutôt qu’un de ses atouts ?

La détection des anomalies aide à repérer des problèmes génétiques.
Le contrôle des filiations permet de vérifier les liens de parenté.
Le suivi des croisements renseigne sur l’avancement des programmes.
Le coût des analyses peut freiner leur utilisation en élevage.

Le coût des analyses peut freiner leur utilisation en élevage.

Explication

Le coût des analyses est une limite, tout comme le besoin de références génétiques et la complexité de l’interprétation. Le contrôle des filiations est au contraire un atout du génotypage.

9. Quelle différence distingue l’action des gènes Extension et Agouti sur la robe du cheval ?

Extension dilue le fond noir sans modifier les crins, tandis qu’Agouti règle la production relative des pigments.
Extension agit sur les crins et les jambes, tandis qu’Agouti modifie la quantité des deux pigments dans tout le corps.
Extension détermine la présence des jambes noires, tandis qu’Agouti commande la couleur de base noire ou alezane.
Extension règle la production relative des pigments, tandis qu’Agouti dilue le fond noir sans modifier les crins ni les jambes.

Extension règle la production relative des pigments, tandis qu’Agouti dilue le fond noir sans modifier les crins ni les jambes.

Explication

Extension contrôle l’équilibre entre eumélanine et phéomélanine, alors qu’Agouti modifie l’expression du noir sur le fond de robe sans toucher aux crins ni aux poils des jambes. L’idée que les deux gènes agissent sur les pigments dans tout le corps ne tient pas compte de l’action localisée d’Agouti.

10. Pourquoi le génotypage peut-il contribuer à accélérer la sélection d’un animal par rapport à l’attente de ses performances ?

Il révèle son patrimoine génétique avant que ses performances soient exprimées.
Il remplace l’analyse de l’ADN par l’observation de ses caractères visibles.
Il détermine ses performances en comparant son échantillon à celui de ses descendants.
Il mesure directement ses performances dès qu’un échantillon est prélevé.

Il révèle son patrimoine génétique avant que ses performances soient exprimées.

Explication

Le génotypage identifie les allèles présents à partir de l’ADN, ce qui renseigne sur le patrimoine génétique sans attendre l’expression des performances. L’observation directe des performances ne fournit pas cette information génétique précoce.

11. Un laboratoire souhaite produire le profil génétique d’un animal à partir d’un échantillon. Quelle séquence d’opérations doit-il suivre ?

Analyser les variations avec une puce, prélever un échantillon, extraire l’ADN, puis établir le profil génétique
Prélever un échantillon, établir le profil génétique, analyser ses variations avec une puce, puis extraire l’ADN
Extraire l’ADN, analyser ses variations avec une puce, prélever un échantillon, puis établir le profil génétique
Prélever un échantillon, extraire l’ADN, analyser ses variations avec une puce, puis établir le profil génétique

Prélever un échantillon, extraire l’ADN, analyser ses variations avec une puce, puis établir le profil génétique

Explication

Le processus commence par le prélèvement, suivi de l’extraction de l’ADN et de l’analyse de ses variations, qui permet ensuite d’obtenir le profil génétique. L’établissement du profil avant l’analyse des variations inverse la logique des étapes.

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Que détermine le génotypage d’un animal à partir de son ADN ?

Les allèles présents chez l’animal.

Quelles sont les quatre étapes du génotypage ?

Prélèvement, extraction de l’ADN, analyse des variations par puce, puis obtention du profil génétique.

Quelles densités de marqueurs proposent les puces de génotypage LD, MD et HD ?

Environ 10 000, 50 000 et 600 000 marqueurs, respectivement.

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