Flashcards : Structure et évolution des génomes — 44 cartes

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1Question

Quelle est la taille approximative du génome humain en Mb ?

Réponse

Environ 3000 Mb.

2Question

Quelle proportion du génome humain est constituée de séquences codant des protéines ?

Réponse

Environ 1,5 % du génome.

3Question

Quelle proportion du génome humain est constituée d'introns et séquences régulatrices ?

Réponse

Environ 27 % du génome.

4Question

Quelle proportion du génome humain est constituée de répétitions en tandem ?

Réponse

Environ 25 % du génome.

5Question

Quelle proportion du génome humain est constituée de répétitions dispersées ?

Réponse

Environ 45 % du génome.

6Question

Comment varie le nombre de gènes avec la taille du génome chez les procaryotes ?

Réponse

Il est proportionnel à la taille du génome.

7Question

Comment varie le nombre de gènes avec la taille du génome chez les eucaryotes ?

Réponse

Il n'est pas proportionnel à la taille du génome.

8Question

Quelle méthode de séquençage est considérée comme ancienne ?

Réponse

Le séquençage de Sanger.

9Question

Quelle méthode permet le séquençage de génomes entiers ?

Réponse

Le séquençage de nouvelle génération.

10Question

Qu'est-ce que l'assemblage d'un génome ?

Réponse

Reconstituer une séquence à partir de fragments qui se chevauchent.

11Question

Pourquoi les séquences répétées compliquent-elles l'assemblage ?

Réponse

Parce que des fragments identiques peuvent être rattachés à plusieurs régions.

12Question

Quelle différence principale existe entre annotation et gène putatif ?

Réponse

L'annotation utilise des données bibliographiques, un gène putatif manque de caractérisation suffisante.

13Question

Quelle base bibliographique sert à l’annotation génomique ?

Réponse

FlyBase est utilisée pour l’annotation génomique.

14Question

Quels critères permettent de comparer des génomes ?

Réponse

La taille, nombre de gènes, proportion d’ADN non codant et quantité d’ADN répétitif.

15Question

Que comprend un gène eucaryote ?

Réponse

Une région transcrite avec des régions codantes, non codantes et régulatrices.

16Question

De quoi dérivent les gènes paralogues ?

Réponse

De la duplication d’un gène ancestral commun.

17Question

Comment apparaissent les gènes orthologues ?

Réponse

Par divergence d’un gène ancestral commun lors d’une spéciation.

18Question

Quelles familles multigéniques sont notamment comprises ?

Réponse

Les familles des globines et des opsines.

19Question

Qu'est-ce qu'un pseudogène unitaire ?

Réponse

Un pseudogène unitaire provient de mutations dans un gène codant sans copie fonctionnelle.

20Question

Quelle est l'origine d'un pseudogène non traité ?

Réponse

Il résulte d'une duplication infidèle produisant une copie mutée avec copie originale fonctionnelle.

21Question

Qu'est-ce qu'un pseudogène traité ?

Réponse

Il provient de la rétrotranscription d'un ARNm en ADN puis insertion dans le génome.

22Question

Où s'insère souvent un pseudogène traité dans le génome ?

Réponse

Souvent à distance du gène parental ou sur un autre chromosome.

23Question

Comment les pseudogènes contribuent-ils à l'évolution ?

Réponse

Ils produisent des protéines tronquées, ARN non codants, hybrides ou interactions chromatiniennes.

24Question

Que sont les microsatellites ?

Réponse

Ce sont des séquences répétées en tandem avec des motifs courts.

25Question

Qu'entraîne une erreur de réplication des microsatellites ?

Réponse

Un mésappariement peut survenir.

26Question

Que peut provoquer une erreur de réparation après mésappariement des microsatellites ?

Réponse

Une modification du nombre de répétitions.

27Question

À quoi sert le polymorphisme des microsatellites ?

Réponse

À réaliser des tests de filiation et identifier des individus.

28Question

Comment les microsatellites sont-ils utilisés en phylogénie ?

Réponse

Pour établir des relations de parenté entre espèces.

29Question

Qu'est-ce qu'un rétrotransposon ?

Réponse

Un élément génétique mobile qui se réplique via un intermédiaire ARN puis s'insère en ADN.

30Question

Quels rétrotransposons comprennent les rétrovirus endogènes ?

Réponse

Les rétrotransposons à LTR.

31Question

Quels rétrotransposons comprennent les LINEs et les SINEs ?

Réponse

Les rétrotransposons sans LTR.

32Question

Comment les SINEs se mobilisent-ils ?

Réponse

En utilisant les protéines produites par les LINEs.

33Question

Que sont les séquences Alu chez les primates ?

Réponse

Des SINEs dérivées de l’ARN 7SL.

34Question

Quelle proportion de l’ADN génomique représentent les séquences Alu ?

Réponse

Environ 10,6 %.

35Question

Quelle contribution l’intégration de rétrovirus a-t-elle apportée ?

Réponse

La création de gènes comme la syncitine.

36Question

Quel rôle joue la syncitine dans les mammifères ?

Réponse

Elle est impliquée dans la diversité des structures placentaires.

37Question

Qu'est-ce qu'un transposon à ADN ?

Réponse

Un élément génétique mobile qui se déplace par « cut and paste ».

38Question

Quel effet provoque l'élément P de la drosophile ?

Réponse

Il provoque une dysgénésie hybride par réarrangements chromosomiques et stérilité.

39Question

Qui a publié en 1950 sur les loci mutables du maïs ?

Réponse

Barbara McClintock.

40Question

Quel est le titre de l'article de Barbara McClintock en 1950 ?

Réponse

The origin and behavior of mutable loci in maize.

41Question

Que peut modifier la mobilité des éléments transposables ?

Réponse

La structure des génomes.

42Question

Quels effets la mobilité des éléments transposables peut-elle avoir ?

Réponse

Modifier l'expression des gènes, provoquer des maladies génétiques ou être domestiquée.

43Question

Quel rôle jouent les piARN maternels chez les femelles P ?

Réponse

Ils répriment les éléments P.

44Question

Que permet l'absence de piARN chez les embryons de femelles M ?

Réponse

La transposition active des éléments P.

Teste-toi avec le QCM

Teste tes connaissances avec un QCM de 26 questions sur Structure et évolution des génomes.

1. Quelle description rend compte de la composition générale du génome humain ?

2. Quelle proportion du génome humain correspond approximativement aux séquences codant des protéines ?

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