📌 Les bactéries commensales sont hébergées par l’hôte sans provoquer de troubles, tandis que les bactéries pathogènes provoquent des troubles chez l’hôte.
Commensale sans trouble, pathogène avec trouble, opportuniste si l’hôte est affaibli
★ À maîtriser
La flore cutanée comprend notamment:
La flore transitoire est souvent abondante sur les mains et joue un rôle dans la transmission croisée.
L’arbre respiratoire inférieur, constitué de la trachée, des bronches et des bronchioles, est stérile.
Le côlon contient 10^11 à 10^12 UFC/g de selles, principalement des anaérobies, ainsi que des entérobactéries et des streptocoques.
Compléments
La réaction inflammatoire est déclenchée par la reconnaissance de l’agent pathogène et la lésion tissulaire, puis recrute des molécules et des cellules effectrices, limite l’extension de l’infection et favorise la réparation des tissus endommagés.
Les signes cliniques comprennent:
Les signes biologiques d’infection et d’inflammation comprennent une hyperleucocytose avec augmentation des polynucléaires neutrophiles et des monocytes, une CRP augmentée au-delà de la normale de 5 mg/L et une PCT augmentée au-delà de la normale de 0,5 ng/mL.
📌 Le diagnostic direct détecte l’agent infectieux ou ses constituants, tandis que le diagnostic indirect détecte une réponse immunitaire spécifique à l’agent suspecté.
Reconnaissance de l’agent et lésion → inflammation, barrière et réparation
★ À maîtriser
🔄 Le processus de prélèvement comprend: la prescription médicale, la préparation du patient et du matériel, le prélèvement des échantillons biologiques, le stockage des échantillons, la vérification et l’identification des échantillons, l’acheminement et la réception au laboratoire, l’analyse des échantillons
La demande d’examen doit mentionner: les nom, prénom, date de naissance, nom de naissance et sexe du patient, le nom du prescripteur, la date et l’heure du prélèvement, l’identité du préleveur, la nature exacte de l’échantillon et du site prélevé, les renseignements cliniques
Compléments
Prescrire → préparer → prélever → identifier → acheminer → analyser
★ À maîtriser
📌 Les prélèvements microbiologiques à visée diagnostique doivent être réalisés le plus tôt possible, avant l’antibiothérapie, avec une technique stérile et un transport rapide au laboratoire.
📌 Les sites normalement stériles, comme le sang, le liquide céphalo-rachidien, les liquides internes et les biopsies, n’ont pas de flore commensale et toute bactérie présente est significative, contrairement aux prélèvements fortement colonisés où la présence bactérienne n’est pas nécessairement significative.
Compléments
📌 Un ECBU doit parvenir au laboratoire en moins de 2 heures ou être conservé à 4 °C pendant 12 heures au maximum, notamment dans un milieu de transport contenant de l’acide borique et en respectant le volume requis.
📌 Pour un ECBU sur sonde à demeure, il ne faut jamais prélever dans le sac collecteur ni rompre le système clos, mais clamper le tuyau pendant 15 minutes, désinfecter le site dédié et prélever avec un adaptateur.
Toiletter → éliminer le premier jet → recueillir le milieu → transférer → identifier
★ À maîtriser
La coproculture recherche a minima:
Une hémoculture diagnostique une bactériémie, une fongémie ou une endocardite infectieuse et consiste à ensemencer des flacons aérobies et anaérobies après une ponction veineuse ou sur dispositif intravasculaire.
Lors d’une hémoculture, chaque flacon reçoit 8 à 10 mL de sang et les flacons sont prélevés avant le reste du bilan.
Compléments
📌 Pour une coproculture, il faut recueillir une noix de selles dès émission et avant l’antibiothérapie, dans un pot hermétiquement fermé, puis l’acheminer rapidement ou la conserver au maximum 12 heures à 4 °C.
★ À maîtriser
📌 Toute fièvre au retour des tropiques doit être considérée a priori comme potentiellement palustre et nécessite une consultation en urgence, notamment en raison du risque de neuropaludisme grave à Plasmodium falciparum.
La recherche du paludisme comprend:
Les schémas de chimioprophylaxie sont:
📌 La ponction lombaire est un acte médical en urgence absolue en cas de suspicion de méningite et doit être réalisée avant l’antibiothérapie si possible, avec trois tubes stériles représentant 2 à 5 mL au total.
Compléments
★ À maîtriser
🔄 Le prélèvement rhinopharyngé suit les étapes suivantes: maintenir la tête droite, introduire délicatement l’écouvillon en suivant le plancher de la fosse nasale, progresser contre la cloison jusqu’à la paroi postérieure du rhinopharynx, effectuer des mouvements de rotation
Le frottis nasopharyngé recherche notamment:
Compléments
📌 Pour un ECBC, l’expectoration est recueillie le matin au réveil après rinçage bucco-dentaire et effort de toux, dans un flacon stérile, puis acheminée en moins de 2 heures.
📌 Le lavage broncho-alvéolaire est un prélèvement protégé réalisé par bronchoscope après instillation puis réaspiration de sérum physiologique, tandis que l’aspiration trachéale ou bronchique expose davantage à la contamination salivaire.
Les prélèvements génitaux chez l’homme comprennent le frottis urétral, les prélèvements d’ulcérations et le premier jet d’urines, tandis que chez la femme ils comprennent les prélèvements vulvaires, vaginaux, endocervicaux, de stérilet, du premier jet d’urines, d’ulcérations et des glandes de Bartholin.
Les principaux agents recherchés sont:
📌 Pour une lésion cutanée inflammatoire, une morsure, une ulcération, une escarre, une lésion nécrotique ou une lésion unguéale, il faut privilégier l’aspiration ou la biopsie après désinfection plutôt qu’un écouvillon.
★ À maîtriser
📌 Les suppurations fermées et les liquides d’épanchement doivent être prélevés par acte médical avec une seringue stérile, sans air, puis acheminés en moins de 2 heures ; les écouvillons sont à bannir.
Le transport des échantillons exige un récipient primaire étanche et résistant, un emballage secondaire solide et étanche avec matériau absorbant si nécessaire, puis un emballage extérieur conforme à l’ADR.
🔄 À la réception, le laboratoire vérifie: l’identification et la concordance avec la demande, la conformité de la demande, la qualité et la quantité du prélèvement, les délais et conditions d’acheminement, l’acceptation ou le refus de la demande
Les précautions standard comprennent: l’hygiène des mains, le port de gants, la gestion des DASRI, la gestion des objets perforants, la gestion des déchets assimilés aux ordures ménagères, la prévention des accidents d’exposition au sang
Compléments
Prélever stérilement → emballer → transporter → réceptionner → accepter ou refuser
| Type | Élément recherché | Exemples |
|---|---|---|
| Direct | Agent infectieux ou constituants | Hémoculture, ECBU, coproculture |
| Indirect | Réponse immunitaire spécifique | Réponse immunitaire dirigée contre l’agent suspecté |
| Site | Flore commensale | Interprétation |
|---|---|---|
| Site normalement stérile | Non | Toute bactérie est significative |
| Urines, prélèvements respiratoires, sperme | Oui | Seuil de significativité nécessaire |
| Peau, selles, muqueuses, gorge | Oui | Présence bactérienne non nécessairement significative |
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Quelle différence entre bactéries commensales et pathogènes ?
Les commensales ne causent pas de troubles, les pathogènes en causent.
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