Principes et défis de la synthèse peptidique

📋 Plan du Cours

1. Liaison peptidique
2. Propriétés des acides aminés
3. Synthèse peptidique
4. Protection des groupes fonctionnels
5. Méthodes de couplage
6. Ligation peptidique
7. Synthèse sur support solide
8. Problèmes en synthèse peptidique
9. Stratégies Boc et Fmoc
10. Réactions secondaires et racémisation

📖 1. Liaison peptidique

🔑 Notions clés & Définitions

• Liaison peptidique : La liaison chimique principale dans les protéines, formée entre le groupe carboxyle d’un acide aminé et le groupe amine d’un autre, résultant en une amide. Elle est caractérisée par une partielle double liaison (~40%) qui confère rigidité et planéité à la structure (source : "The Peptide Bond").
• Caractère partiel de double liaison : La liaison peptidique possède une hybridation de résonance entre un caractère simple et double, ce qui explique sa stabilité et sa rigidité. La distance C-N est d’environ 1,32 Å, intermédiaire entre une liaison simple (1,49 Å) et une double (1,27 Å).
• Planarité et rigidité : La liaison peptidique est planar et rigide, empêchant la rotation autour de la liaison C-N, ce qui limite la flexibilité de la chaîne polypeptidique. La configuration trans est toujours privilégiée, évitant les interactions stériques indésirables (source : "Characteristics of peptide bond").
• Configuration trans : La majorité des liaisons peptidiques adoptent la configuration trans, minimisant ainsi les interactions stériques…